Mısır fetva kurumu Ayasofya'nın yeniden cami olarak açılmasının gündeme gelmesi üzerine Facebook'ta, İstanbul'un fethini Osmanlı işgali olarak tanımlamış ve "Ayasofya 537 yılında Bizans döneminde bir kilise olarak inşa edildi ve Osmanlılar 1453'te İstanbul'u işgal edinceye ve onu camiye çevirinceye kadar 916 yıl kilise olarak kaldı." ifadesini kullanmıştı.

Kurumun bu açıklamasının sosyal medyada büyük tepki çekmesi üzerine geri adım atılarak yapılan yeni açıklamada ise "büyük fethin sufi Osmanlı Sultanı Fatih Sultan Mehmet Han'ın eliyle gerçekleştirildiği, Cumhurbaşkanı Recep Tayyip Erdoğan'ın ise Sultan Mehmet'le hiçbir bağının olmadığı" kaydedilmişti. 

Ayrıca Mısır fetva kurumu'nun bu çıkışına Dünya Müslüman Alimler Birliği'nden kınama gelmişti. Birliğin Genel Sekreteri Ali Muhyiddin el-Karadaği, İstanbul'un fethinin Osmanlı işgali olarak tanımlanmasının Mısır açısından ve kurum için utanç lekesi olduğunu söyledi.